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 Given that ikiwiki has a suggested use as a tool for developers, I was thinking it might be cool if ikiwiki had [Doxygen](http://www.doxygen.org/) support.  I'm not exactly sure how the integration would work.  Something along the lines of a plugin to support .dox files would be my first thought.  I'd leave generating the documentation from any source files for a separate run of Doxygen - it'd be easier and you probably don't want the source being edited over the web.