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@@ -6,12 +6,12 @@ ikiwiki - a wiki compiler
 
 ikiwiki [options] source destination
 
 
 ikiwiki [options] source destination
 
-ikiwiki --setup configfile
+ikiwiki --setup setupfile
 
 # DESCRIPTION
 
 
 # DESCRIPTION
 
-`ikiwiki` is a wiki compiler. It builds static html pages for a wiki, from
-`source` in the [[MarkDown]] language (or others), and writes it out to
+`ikiwiki` is a wiki compiler. It builds static HTML pages for a wiki, from
+`source` in the [[ikiwiki/Markdown]] language (or others), and writes it out to
 `destination`.
 
 Note that most options can be shortened to single letters, and boolean
 `destination`.
 
 Note that most options can be shortened to single letters, and boolean
@@ -19,7 +19,7 @@ flags such as --verbose can be negated with --no-verbose.
 
 # MODE OPTIONS
 
 
 # MODE OPTIONS
 
-These options control the mode that ikiwiki is operating in.
+These options control the mode that ikiwiki operates in.
 
 * --refresh
 
 
 * --refresh
 
@@ -30,11 +30,46 @@ These options control the mode that ikiwiki is operating in.
 
   Force a rebuild of all pages.
 
 
   Force a rebuild of all pages.
 
+* --setup setupfile
+
+  The default action when --setup is specified is to automatically generate
+  wrappers for a wiki based on data in a setup file, and rebuild the wiki.
+  If you only want to build any changed pages, you can use --refresh with
+  --setup.
+
+* --changesetup setupfile
+
+  Reads the setup file, adds any configuration changes specified by other
+  options, and writes the new configuration back to the setup file. Also
+  updates any configured wrappers. In this mode, the wiki is not fully
+  rebuilt, unless you also add --rebuild.
+
+  Example, to enable some plugins:
+
+       ikiwiki --changesetup ~/ikiwiki.setup --plugin goodstuff --plugin calendar
+
+* --dumpsetup setupfile
+
+  Causes ikiwiki to write to the specified setup file, dumping out
+  its current configuration.
+
+* --wrappers
+
+  If used with --setup --refresh, this makes it also update any configured
+  wrappers.
+
+* --clean
+
+  This makes ikiwiki clean up by removing any files it generated in the
+  `destination` directory, as well as any configured wrappers, and the
+  `.ikiwiki` state directory. This is mostly useful if you're running
+  ikiwiki in a Makefile to build documentation and want a corresponding
+  `clean` target.
+
 * --cgi
 
   Enable [[CGI]] mode. In cgi mode ikiwiki runs as a cgi script, and
 * --cgi
 
   Enable [[CGI]] mode. In cgi mode ikiwiki runs as a cgi script, and
-  supports editing pages, signing in, registration, and displaying
-  [[RecentChanges]].
+  supports editing pages, signing in, and registration.
 
   To use ikiwiki as a [[CGI]] program you need to use --wrapper or --setup
   to generate a wrapper. The wrapper will generally need to run suid 6755 to
 
   To use ikiwiki as a [[CGI]] program you need to use --wrapper or --setup
   to generate a wrapper. The wrapper will generally need to run suid 6755 to
@@ -51,23 +86,6 @@ These options control the mode that ikiwiki is operating in.
 
   Note that the generated wrapper will ignore all command line parameters.
 
 
   Note that the generated wrapper will ignore all command line parameters.
 
-* --setup configfile
-
-  In setup mode, ikiwiki reads the config file, which is really a perl
-  program that can call ikiwiki internal functions.
-
-  [[ikiwiki.setup]] is an example of such a config file.
-
-  The default action when --setup is specified is to automatically generate
-  wrappers for a wiki based on data in a config file, and rebuild the wiki.
-  If you only want to build any changed pages, you can use --refresh with
-  --setup.
-
-* --wrappers
-
-  If used with --setup --refresh, this makes it also update any configured
-  wrappers.
-
 * --aggregate
 
   If the [[plugins/aggregate]] plugin is enabled, this makes ikiwiki poll
 * --aggregate
 
   If the [[plugins/aggregate]] plugin is enabled, this makes ikiwiki poll
@@ -86,27 +104,42 @@ These options control the mode that ikiwiki is operating in.
 
        ikiwiki --setup ~/ikiwiki.setup --render foo.mdwn
 
 
        ikiwiki --setup ~/ikiwiki.setup --render foo.mdwn
 
+* --post-commit
+
+  Run in post-commit mode, the same as if called by a [[post-commit]] hook.
+  This is probably only useful when using ikiwiki with a web server on one host
+  and a repository on another, to allow the repository's real post-commit
+  hook to ssh to the web server host and manually run ikiwiki to update
+  the web site.
+
 * --version
 
 * --version
 
-  Print ikiwiki version number.
+  Print ikiwiki's version number.
 
 # CONFIG OPTIONS
 
 These options configure the wiki. Note that [[plugins]] can add additional
 
 # CONFIG OPTIONS
 
 These options configure the wiki. Note that [[plugins]] can add additional
-configuration options of their own.
+configuration options of their own. All of these options and more besides can
+also be configured using a setup file.
 
 
-* --wikiname
+* --wikiname name
 
   The name of the wiki, default is "wiki".
 
 
   The name of the wiki, default is "wiki".
 
-* --templatedir
+* --templatedir dir
 
 
-  Specify the directory that the page [[templates]] are stored in. Default
-  is `/usr/share/ikiwiki/templates`, or another location as configured at
+  Specify the directory that [[templates|templates]] are stored in.
+  Default is `/usr/share/ikiwiki/templates`, or another location as configured at
   build time. If the templatedir is changed, missing templates will still
   build time. If the templatedir is changed, missing templates will still
-  be searched for in the default location as a fallback.
+  be searched for in the default location as a fallback. Templates can also be
+  placed in the "templates/" subdirectory of the srcdir.
 
 
-* --underlaydir
+  Note that if you choose to copy and modify ikiwiki's templates, you will need
+  to be careful to keep them up to date when upgrading to new versions of
+  ikiwiki. Old versions of templates do not always work with new ikiwiki
+  versions.
+
+* --underlaydir dir
 
   Specify the directory that is used to underlay the source directory.
   Source files will be taken from here unless overridden by a file in the
 
   Specify the directory that is used to underlay the source directory.
   Source files will be taken from here unless overridden by a file in the
@@ -117,126 +150,154 @@ configuration options of their own.
 
   Specify a mode to chmod the wrapper to after creating it.
 
 
   Specify a mode to chmod the wrapper to after creating it.
 
-* --notify
-
-  Enable email notification of commits. This should be used when running
-  ikiwiki as a [[post-commit]] hook.
-
-* --rcs=svn, --no-rcs
-
-  Enable or disable use of a revision control system.
+* --wrappergroup group
 
 
-  If you use svn, the `source` directory is assumed to be
-  a [[Subversion]] working copy.
+  Specify what unix group the wrapper should be owned by. This can be
+  useful if the wrapper needs to be owned by a group other than the default.
+  For example, if a project has a repository with multiple committers with
+  access controlled by a group, it makes sense for the ikiwiki wrappers
+  to run setgid to that group.
 
 
-  If you use git, the `source` directory is assumed to be a clone of the
-  [[git]] repository.
+* --rcs=svn|git|.., --no-rcs
 
 
-  If you use tla, the `source` directory is assumed to be a tla import.
+  Enable or disable use of a [[revision_control_system|rcs]].
 
 
-  If you use mercurial, the `source` directory is assumed to be the
-  [[mercurial]] repository.
+  The `source` directory will be assumed to be a working copy, or clone, or
+  whatever the revision control system you select uses.
 
 
-  In [[CGI]] mode, with a revision control system enabled pages edited via
-  the web will be committed. Also, the [[RecentChanges]] link will be placed
-  on pages.
+  In [[CGI]] mode, with a revision control system enabled, pages edited via
+  the web will be committed.
 
   No revision control is enabled by default.
 
 * --svnrepo /svn/wiki
 
 
   No revision control is enabled by default.
 
 * --svnrepo /svn/wiki
 
-  Specify the location of the svn repository for the wiki. This is required
-  for using --notify with [[subversion]].
+  Specify the location of the svn repository for the wiki.
 
 * --svnpath trunk
 
 
 * --svnpath trunk
 
-  Specify the path inside your svn reporistory where the wiki is located.
-  This defaults to trunk; change it if your wiki is at some other location
-  inside the repository.
+  Specify the path inside your svn repository where the wiki is located.
+  This defaults to `trunk`; change it if your wiki is at some other path
+  inside the repository. If your wiki is rooted at the top of the repository,
+  set svnpath to "".
 
 
-* --anonok, --noanonok
-
-  If anonok is set, it will allow anonymous web users, who have not signed in, to make changes to the wiki.
+* --rss, --norss
 
 
-  By default, anonymous users cannot edit the wiki.
+  If rss is set, ikiwiki will default to generating RSS feeds for pages
+  that inline a [[blog]].
 
 
-* --rss, --norss
+* --allowrss
 
 
-  If rss is set, ikiwiki will generate RSS feeds for pages that inline
-  a [[blog]].
+  If allowrss is set, and rss is not set, ikiwiki will not default to
+  generating RSS feeds, but setting `rss=yes` in the inline directive can
+  override this default and generate a feed.
 
 * --atom, --noatom
 
 
 * --atom, --noatom
 
-  If atom is set, ikiwiki will generate Arom feeds for pages that inline
-  a [[blog]].
+  If atom is set, ikiwiki will default to generating Atom feeds for pages
+  that inline a [[blog]].
+
+* --allowatom
+
+  If allowatom is set, and rss is not set, ikiwiki will not default to
+  generating Atom feeds, but setting `atom=yes` in the inline directive can
+  override this default and generate a feed.
 
 
-* --pingurl url
+* --pingurl URL
 
 
-  Set this to the url to an XML-RPC service to ping when an RSS feed is
-  updated. For example, to ping Technorati, use the url
+  Set this to the URL of an XML-RPC service to ping when an RSS feed is
+  updated. For example, to ping Technorati, use the URL
   http://rpc.technorati.com/rpc/ping
 
   This parameter can be specified multiple times to specify more than one
   http://rpc.technorati.com/rpc/ping
 
   This parameter can be specified multiple times to specify more than one
-  url to ping.
+  URL to ping.
 
 
-* --url url
+* --url URL
 
 
-  Specifies the url to the wiki. This is a required parameter in [[CGI]] mode.
+  Specifies the URL to the wiki. This is a required parameter in [[CGI]] mode.
 
 
-* --cgiurl http://url/ikiwiki.cgi
+* --cgiurl http://example.org/ikiwiki.cgi
 
 
-  Specifies the url to the ikiwiki [[CGI]] script wrapper. Required when
+  Specifies the URL to the ikiwiki [[CGI]] script wrapper. Required when
   building the wiki for links to the cgi script to be generated.
 
   building the wiki for links to the cgi script to be generated.
 
-* --historyurl url
+* --historyurl URL
 
 
-  Specifies the url to link to for page history browsing. In the url,
+  Specifies the URL to link to for page history browsing. In the URL,
   "\[[file]]" is replaced with the file to browse. It's common to use
   "\[[file]]" is replaced with the file to browse. It's common to use
-  [[ViewCVS]] for this.
+  [[ViewVC]] for this.
 
 
-* --adminemail you@yourhost
+* --adminemail you@example.org
 
   Specifies the email address that ikiwiki should use for sending email.
 
 
   Specifies the email address that ikiwiki should use for sending email.
 
-* --diffurl url
+* --diffurl URL
 
 
-  Specifies the url to link to for a diff of changes to a page. In the url,
+  Specifies the URL to link to for a diff of changes to a page. In the URL,
   "\[[file]]" is replaced with the file to browse, "\[[r1]]" is the old
   revision of the page, and "\[[r2]]" is the new revision. It's common to use
   "\[[file]]" is replaced with the file to browse, "\[[r1]]" is the old
   revision of the page, and "\[[r2]]" is the new revision. It's common to use
-  [[ViewCVS]] for this.
+  [[ViewVC]] for this.
 
 * --exclude regexp
 
   Specifies a rexexp of source files to exclude from processing.
   May be specified multiple times to add to exclude list.
 
 
 * --exclude regexp
 
   Specifies a rexexp of source files to exclude from processing.
   May be specified multiple times to add to exclude list.
 
+* --include regexp
+
+  Specifies a rexexp of source files, that would normally be excluded,
+  but that you wish to include in processing.
+  May be specified multiple times to add to include list.
+
 * --adminuser name
 
 * --adminuser name
 
-  Specifies a username of a user who has the powers of a wiki admin.
-  Currently allows locking of any page, other powers may be added later.
-  May be specified multiple times for multiple admins.
+  Specifies a username of a user (or, if openid is enabled, an openid) 
+  who has the powers of a wiki admin. Currently allows locking of any page,
+  and [[banning|banned_users]] users, as well as powers granted by
+  enabled plugins (such as [[moderating comments|plugins/moderatedcomments]] 
+  and [[plugins/websetup]]. May be specified multiple times for multiple
+  admins.
+
+  For an openid user specify the full URL of the login, including "http://".
 
 * --plugin name
 
   Enables the use of the specified [[plugin|plugins]] in the wiki. 
 
 * --plugin name
 
   Enables the use of the specified [[plugin|plugins]] in the wiki. 
-  Note that plugin names are case sensative.
+  Note that plugin names are case sensitive.
 
 * --disable-plugin name
 
   Disables use of a plugin. For example "--disable-plugin htmlscrubber"
 
 * --disable-plugin name
 
   Disables use of a plugin. For example "--disable-plugin htmlscrubber"
-  to do away with html sanitization.
+  to do away with HTML sanitization.
+
+* --libdir directory
+
+  Makes ikiwiki look in the specified directory first, before the regular
+  locations when loading library files and plugins. For example, if you set
+  libdir to "/home/you/.ikiwiki/", you can install a foo.pm plugin as
+  "/home/you/.ikiwiki/IkiWiki/Plugin/foo.pm".
 
 * --discussion, --no-discussion
 
   Enables or disables "Discussion" links from being added to the header of
   every page. The links are enabled by default.
 
 
 * --discussion, --no-discussion
 
   Enables or disables "Discussion" links from being added to the header of
   every page. The links are enabled by default.
 
+* --numbacklinks n
+
+  Controls how many backlinks should be displayed at the bottom of a page.
+  Excess backlinks will be hidden in a popup. Default is 10. Set to 0 to
+  disable this feature.
+
 * --userdir subdir
 
   Optionally, allows links to users of the wiki to link to pages inside a
   subdirectory of the wiki. The default is to link to pages in the toplevel
   directory of the wiki.
 
 * --userdir subdir
 
   Optionally, allows links to users of the wiki to link to pages inside a
   subdirectory of the wiki. The default is to link to pages in the toplevel
   directory of the wiki.
 
+* --htmlext html
+
+  Configures the extension used for generated html files. Default is "html".
+
 * --timeformat format
 
   Specify how to display the time or date. The format string is passed to the
 * --timeformat format
 
   Specify how to display the time or date. The format string is passed to the
@@ -248,7 +309,16 @@ configuration options of their own.
 
 * --syslog, --no-syslog
 
 
 * --syslog, --no-syslog
 
-  Log to syslog.
+  Log to syslog(3).
+
+* --usedirs, --no-usedirs
+
+  Toggle creating output files named page/index.html (default) instead of page.html.
+
+* --prefix-directives, --no-prefix-directives
+
+  Toggle new '!'-prefixed syntax for preprocessor directives.  ikiwiki currently
+  defaults to --prefix-directives.
 
 * --w3mmode, --no-w3mmode
 
 
 * --w3mmode, --no-w3mmode
 
@@ -261,16 +331,59 @@ configuration options of their own.
   intercepted. If you enable this option then you must run at least the 
   CGI portion of ikiwiki over SSL.
 
   intercepted. If you enable this option then you must run at least the 
   CGI portion of ikiwiki over SSL.
 
-* --getctime
+* --gettime, --no-gettime
+
+  Extract creation and modification times for each new page from the
+  the revision control's log. This is done automatically when building a
+  wiki for the first time, so you normally do not need to use this option.
+
+* --set var=value
+  
+  This allows setting an arbitrary configuration variable, the same as if it
+  were set via a setup file. Since most commonly used options can be
+  configured using command-line switches, you will rarely need to use this.
+
+* --set-yaml var=value
+
+  This is like --set, but it allows setting configuration variables that
+  use complex data structures, by passing in a YAML document.
+
+# EXAMPLES
+
+* ikiwiki --setup my.setup
+
+  Completely (re)build the wiki using the specified setup file.
+
+* ikiwiki --setup my.setup --refresh
+
+  Refresh the wiki, using settings from my.setup, and avoid
+  rebuilding any pages that have not changed. This is faster.
+
+* ikiwiki --setup my.setup --refresh --wrappers
+
+  Refresh the wiki, including regnerating all wrapper programs,
+  but do not rebuild all pages. Useful if you have changed something
+  in the setup file that does not need a full wiki rebuild to update
+  all pages, but that you want to immediatly take effect.
+
+# ENVIRONMENT
+
+* CC
+
+  This controls what C compiler is used to build wrappers. Default is 'cc'.
+
+* CFLAGS
+
+  This can be used to pass options to the C compiler when building wrappers.
+
+# SEE ALSO
 
 
-  Pull last changed time for each new page out of the revision control
-  system. This rarely used option provides a way to get the real creation
-  times of items in weblogs, for example when building a wiki from a new
-  subversion checkout. It is unoptimised and quite slow. It is best used
-  with --rebuild, to force ikiwiki to get the ctime for all pages.
+* [[ikiwiki-mass-rebuild]](8)
+* [[ikiwiki-update-wikilist]](1)
+* [[ikiwiki-transition]](1)
 
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-Joey Hess <joey@kitenet.net>
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