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@@ -13,7 +13,7 @@ interface, need the new format setup file.
 You can convert old setup files into the new format by running
 `ikiwiki-transition setupformat your.setup`
 
-# moving settings from Preferences page
+## moving settings from Preferences page
 
 The admin preferences page used to have settings for allowed attachments,
 locked pages, and banned users. These three settings have moved to the
@@ -21,7 +21,7 @@ setup file, and will no longer appear on the admin preferences page once
 your wiki is upgraded to 3.0.
 
 You can move these preferences into the setup file by running
-`ikiwiki-transition moveprefs your.setup`
+`ikiwiki-transition moveprefs your.setup; ikiwiki -setup your.setup -refresh -wrappers`
 
 (Make sure you have converted the setup file to the new format first.)
 
@@ -37,8 +37,8 @@ following to your setup file:
        
        prefix_directives => 0,
 
-To convert to the new syntax, run 
-`ikiwiki-transition prefix_directives your.setup`
+To convert to the new syntax, make sure that your setup file does *not*
+contain the above, then run `ikiwiki-transition prefix_directives your.setup`
 
 (And then commit the changes it makes to pages in your srcdir.)